Флора Байкала – набор семейств, родов, видов растений в процессе эволюции сложившийся на каждом континенте. В каждой области суши двух совершенно одинаковых флор на земном шаре не найдете. Различие объясняются в основном разнообразием климата, почв, горных пород, геологическим прошлым, географической изоляцией той или иной области, в результате чего во флоре встречаются растения эндемики.

Древность территории вместе с разнообразием природных условий сделали возможным формирование в районе озера Байкал богатой флоры, она содержит довольно много уникальных видов. Например, только в субальпийском поясе хребта Хамар-Дабан на южном побережье в озеро Байкал произрастает сверция байкальская из семейства горечавковых. Лишь, на небольшом участке западного побережья озера Байкал, между мысами Отто-Хушун и Зама, обнаружен копеечник зундукский из семейства бобовых.

Юго-восточный район озера Байкал, на Хамар-Дабане имеет своеобразную растительность, и, прежде всего, это обилие дубово-грабовых лесов. На северном склоне Хамар-Дабана - высотное распределение растительности, так на байкальских террасах располагаются елово-кедровые и пихтово-кедровые леса, а также сфагновые болота, причем на крутых каменистых участках преобладает кедр, а по днищам падей пихта, озеро Байкал и в прибрежной полосе встречаются: кедровый стланик, рододендрон золотистый, филодоце голубая, кашкара. На обращенном к озеру Байкал склоне Хамар-Дабана выпадает много дождей, поэтому леса растут от самого берега озера и образованы кедром и пихтой с багульником и брусникой. На противоположном, обращенном к реке Джида склоне, где дождей выпадает мало, степи не только занимают долины рек, но и поднимаются выше по склонам гор, постепенно сменяясь лиственнично-сосновыми лесами.

На южном побережье озера Байкал, т.е. в низовьях рек Выдриная, Утулик и других пунктах в пределах Слюдянского района Иркутской области и Кабанского района Республики Бурятия, близ курорта Аршан на террасах в приустьевой части рек растет голубая ель. От обычной сибирской ели отличается голубой окраской хвои, которая создана наличием сизого воскового налета. Происхождение этой разновидности сибирской ели, обладающей высокой декоративностью, загадочно.

Реликтовый ельник на острове Ольхон – еще одна из ботанических тайн озера Байкал. Реликтовые растения являются свидетелями растительного мира, отдаленного времени, когда климат и рельеф местности значительно отличались от современных. Южное побережье озера Байкал в районе хребта Хамар-Дабан особенно богато являющимися пережитками растительности широколиственных лесов. Обилие осадков, которые смягчают суровость климата и наличие термальных источников, благоприятствуют сохранению древних теплолюбивых растений, по той же причине, южное побережье озера Байкал богато сорными и заносными растениями - выходцами из Европейской части страны. В средней части западного побережья озера Байкал, до сих пор сохранились в качестве реликта со времен ледникового периода тундростепи . Это степные и тундровые растительные сообщества расположены особенно на известняковых отрогах Приморского хребта между мысами Отто-Хушун и Зама, реликты представляют собой живые ископаемые . Это последние свидетели этапов эволюции растительного покрова озера Байкал, сохранившиеся до наших дней.

Своеобразна флора Ушканьих островов и Чувыркуйского залива, там 280 видов растений, относящихся к 164 родам, 53 семействам. Это злаки, сложноцветные, розоцветные, лютиковые, зонтичные, осоковые, ивовые. В растительном покрове преобладают лиственничные и сосновые леса Сибири, древостои с разными поколениями возрастов, хорошо сомкнуты, имеют хорошее и удовлетворительное возобновление.

Деревья северной части бухты Песчаной на озере Байкал, близ мыса Большая Колокольня получили название ходульные и состоят из лиственниц и одной сосны. На побережье озера Байкал изумительно красивые, интересные и живописные природные пейзажи, богатая растительность, особенно хвойная, содержащая фитонциды, различные плодовые и ягодные растения. Склоны гор покрыты сосновыми и лиственнично-сосновыми лесами, с брусникой, багульником и хорошим лесным разнотравьем Сибири. На водоразделах растут пихтово-кедровые леса с черникой. Вся удивительная природа озера Байкал требует к себе чуткого, бережного отношения.